मानव ऊतक भंडार और ऊतक विश्लेषण

मानव ऊतक भंडार और ऊतक विश्लेषण साझा संसाधन (HTR-TASR) को संयुक्त रूप से कैंसर केंद्र और पैथोलॉजी विभाग द्वारा वित्त पोषित किया जाता है। इनकी स्थापना कैंसर सेंटर, पैथोलॉजी विभाग, मेडिसिन स्कूल और सभी संस्थानों में फैकल्टी के ट्रांसलेशनल रिसर्च को सुविधाजनक बनाने के लिए की गई है। यह वेबसाइट एचटीआर-टीएएसआर स्टाफ सदस्यों की पेशकश की गई सेवाओं और संपर्क विवरण का वर्णन करती है जो नमूना उपलब्धता और ऊतक विज्ञान और आणविक विकृति के सभी पहलुओं पर सलाह दे सकते हैं।

उद्देश्य

उपयुक्त नैतिक, वैज्ञानिक और विधायी सिद्धांतों और विनियमों का पालन करते हुए वैज्ञानिक जांच में उपयोग के लिए UNM शोधकर्ताओं को उच्च गुणवत्ता वाले मानव ऊतक के नमूनों के अधिग्रहण, भंडारण और वितरण की सुविधा के लिए।

हम उपयोग जैव नमूना संसाधनों के लिए एनसीआई सर्वोत्तम अभ्यास हमारे मार्गदर्शक के रूप में।

एचटीआर-ऊतक के बारे में

एचटीआर-ऊतक साझा संसाधन:

  • शोधकर्ताओं को अच्छी तरह से संरक्षित और अनुरक्षित ऊतकों तक पहुंच की अनुमति देकर भविष्य के रोगियों को लाभ पहुंचाता है जो अन्यथा उपलब्ध नहीं हो सकते हैं
  • अभिनव और चिकित्सकीय रूप से मूल्यवान अनुसंधान को बढ़ावा देने के माध्यम से गुणवत्तापूर्ण रोगी देखभाल प्रदान करने के मिशन को मजबूत करके यूएनएम एचएससी के लाभ
  • 18 एचआईपीएए व्यक्तिगत पहचानकर्ताओं से रहित गैर-पहचाने गए नमूनों के वितरण में एचटीआर का ईमानदार दलाल कार्य शोधकर्ताओं को संभावित एचआईपीएए जटिलताओं/उल्लंघनों से बचाता है।

TASR विभिन्न प्रकार प्रदान करता है ऊतक विज्ञान सेवाएं, प्रसंस्करण और पैराफिन एम्बेडिंग, पैराफिन और जमे हुए सेक्शनिंग, एच एंड ई धुंधला, आईएचसी धुंधला, टीएमए निर्माण, स्लाइड डिजिटाइज़िंग और छवि विश्लेषण सहित।

अनुदान आवेदनों के लिए एचटीआर-टीएएसआर सेवाओं का सारांश

मानव ऊतक भंडार और ऊतक विश्लेषण साझा संसाधन (HTR-TASR) में कई तकनीकों का प्रदर्शन करने की क्षमता है और सेवा के आधार पर शुल्क पर विभिन्न प्रकार की सेवाएं प्रदान करता है।

एचटीआर-टीएएसआर मुख्य रूप से बाएं ओवर के सर्जिकल नमूनों से मिलान किए गए सामान्य और ट्यूमर के ऊतकों को इकट्ठा करता है, और उन्हें या तो जमे हुए या फॉर्मेलिन-फिक्स्ड पैराफिन एम्बेडेड (एफएफपीई) ब्लॉक के रूप में संग्रहीत करता है। जांचकर्ता आईआरबी (मानव अनुसंधान सुरक्षा कार्यालय) और ऊतक अनुसंधान निरीक्षण समिति (टीआरओसी, पूर्व में एसआरसी) से आवश्यक अनुमोदन के साथ ऊतकों का अनुरोध कर सकते हैं।

एचटीआर-टीएएसआर कई अलग-अलग ऊतक विज्ञान और आणविक सेवाएं भी प्रदान कर सकता है, जैसे कि सेक्शनिंग और एच एंड ई धुंधला, इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री और इम्यूनोफ्लोरेसेंस वेंटाना डिस्कवरी अल्ट्रा प्लेटफॉर्म का उपयोग करके, कस्टम टिशू माइक्रोएरे (टीएमए) का निर्माण, स्लाइड डिजिटाइज़िंग (ब्राइटफ़ील्ड और फ्लोरोसेंट) के माध्यम से एपरियो वर्सा 200, और हेलो ™ प्लेटफॉर्म का उपयोग करके छवि विश्लेषण (इंडिका लैब्स से, अल्बुकर्क, एनएम में मुख्यालय)।

नेक्सेलम सेलोमीटर 1000 के माध्यम से सेल काउंट और व्यवहार्यता के प्रदर्शन सहित विभिन्न प्रकार के रक्त प्रसंस्करण उपलब्ध हैं।

कुछ जांचकर्ताओं को विशेष रूप से तैयार नमूनों की आवश्यकता होती है या विशिष्ट नमूना आवश्यकताएं होती हैं। इन अनुमोदित अध्ययनों के लिए, एचटीआर कर्मचारी संभावित रूप से नमूने एकत्र करेंगे और शोधकर्ताओं की जरूरतों के अनुरूप प्रक्रिया करेंगे। इसके अलावा, कुछ आणविक सेवाएं उपलब्ध हैं, जैसे डीएनए और आरएनए निष्कर्षण, पीसीआर और रीयल-टाइम पीसीआर। वांछित सेवाओं पर चर्चा करने के लिए तकनीकी प्रबंधक और संचालन प्रबंधक के साथ एक व्यवहार्यता बैठक स्थापित की जानी चाहिए।

इस साझा संसाधन के उपयोग को स्वीकार करने के लिए, कृपया अपने प्रकाशनों में निम्नलिखित शामिल करें:

इस शोध को आंशिक रूप से UNM कॉम्प्रिहेंसिव कैंसर सेंटर सपोर्ट ग्रांट NCI P30CA118100 द्वारा समर्थित किया गया था और मानव ऊतक रिपोजिटरी और ऊतक विश्लेषण साझा संसाधन का उपयोग किया गया था, जिसे न्यू मैक्सिको स्कूल ऑफ मेडिसिन डिपार्टमेंट ऑफ पैथोलॉजी से अतिरिक्त समर्थन प्राप्त होता है।

संपर्क एचटीआर-ऊतक

टेलीफोन: (505) 272 1127
ईमेल: ऊतकबैंक@salud.unm.edu
फिट्ज़ हॉल के कमरे 306B, और 306C
यूएनएम एचएससी स्कूल ऑफ मेडिसिन
पैथोलॉजी विभाग
एमएससी 08-4640
915 कैमिनो डी सालुद, पूर्वोत्तर
अल्बुकर्क, एनएम एक्सएनयूएमएक्स

एचटीआर-टीए कार्मिक

डेनिस मैककैंस, पीएचडीडेनिस जे मैककैंस पीएचडी

रिसर्च प्रोफेसर, पैथोलॉजी

वैज्ञानिक निदेशक

संसाधन के सभी पहलुओं की देखरेख करता है

एडगर फिशर, एमडीएडगर फिशर एमडी

प्रोफेसर, पैथोलॉजी

चिकित्सा निदेशक

संसाधन के गुणवत्ता नियंत्रण पहलुओं की देखरेख करता है

कैथलीन मार्टिनेज, पीडीकैथलीन मार्टिनेज PA

तकनीकी प्रबंधक

संसाधन के तकनीकी पहलुओं की देखरेख करता है

सैडी ला बाउवे, पीएचडीसैडी ला बाउव पीएचडी

संचालन विशेषज्ञ

दिन-प्रतिदिन की जिम्मेदारियों का प्रबंधन करता है

फ्रेड शुल्त्स, MAफ्रेड शुल्त्स, MA

सूचना प्रबंधन

ऊतक विज्ञान और आणविक विकृति सेवाएं

ऊतक प्रसंस्करण और पैराफिन-एम्बेडिंग या ऊतक का स्नैप फ्रीजिंग। ऊतक को एच एंड ई दाग के साथ दाग दिया जा सकता है या बिना दाग रह सकता है।

प्रयोगशाला पहले से मौजूद प्रोटोकॉल का उपयोग करके मानक एंटीबॉडी के साथ ऊतक वर्गों को दाग सकती है। वैकल्पिक रूप से, प्रयोगशाला वेंटाना डिस्कवरी प्लेटफॉर्म का उपयोग करके एंटीबॉडी का काम कर सकती है जो धुंधला परिणामों को अनुकूलित करने के लिए कई धुंधला संयोजनों की अनुमति देता है।

एचईआर -2 और ईआर छवि
HER-2 और ER . के लिए दोहरा धुंधलापन
एचटीआर ऊतक माइक्रोएरे - ई-कैडरिनcad

ऊतक माइक्रोएरे डिजाइन और निर्माण: इसमें दाता पैराफिन ब्लॉक एकत्र करना, रुचि के क्षेत्रों का चयन करना और कोर को एक खाली प्राप्तकर्ता पैराफिन ब्लॉक में रखना शामिल है। फायदे गति और लागत में हैं, क्योंकि एक स्लाइड पर कई नमूनों का मूल्यांकन किया जा सकता है। ठेठ टीएमए में 50 मिमी-200 मिमी व्यास के लगभग 0.6 से 2.0 कोर होते हैं। एक टीएमए ब्लॉक से लगभग ५० खंड प्राप्त किए जा सकते हैं।

 

(दाईं ओर: ई-कैडरिन)

HTR-TASR कर्मी UNM अस्पताल से अभिलेखीय ऊतक ब्लॉकों को पुनः प्राप्त कर सकते हैं।

इसमें आमतौर पर सर्जिकल पैथोलॉजिस्ट सूक्ष्म समीक्षा के लिए नैदानिक ​​​​नमूने लिए जाने के बाद सर्जिकल शोधन के समय बचे हुए अतिरिक्त या अवशेष ऊतकों का संग्रह शामिल होता है और रोगी की देखभाल के लिए संभावित भविष्य के परीक्षण के लिए पैराफिन में पर्याप्त नमूना रखा जाता है। एचटीआर-टीएएसआर कर्मी यूएनएम एचएससी सर्जिकल पैथोलॉजी के सकल विच्छेदन कक्ष में ऊतकों को एकत्र करेंगे। वर्तमान में, एचटीआर वेनिपंक्चर नहीं करता है, लेकिन शोधकर्ताओं द्वारा अनुरोध किए गए ऐसे नमूनों को बैंक करेगा।

एचटीआर-टीएएसआर परियोजना सलाहकार पैथोलॉजी और क्लिनिकल डेटा एकत्र कर सकते हैं जो एचआईपीएए पहचानकर्ताओं से अलग हो जाते हैं जबकि मिलान नमूनों के लिए कोडित होते हैं।

छवि विश्लेषण

H&E या इम्यूनोहिस्टोकेमिकली अभिरंजित ऊतक वर्गों की छवियों को Leica AT2 डिजिटल स्कैनर पर कैप्चर किया जाता है और HALO इमेजिंग और एनोटेशन सॉफ़्टवेयर पर अपलोड किया जाता है।

हेलो सॉफ्टवेयर आपको ऊतक (ट्यूमर, स्ट्रोमा, मांसपेशी, वसा आदि) को एनोटेट करने और फिर उन कोशिकाओं की गणना करने की अनुमति देता है जो इन एनोटेट क्षेत्रों में से प्रत्येक के भीतर पसंद के प्रोटीन (चित्रा, दाएं) के लिए सकारात्मक हैं। यह आपको निकटतम पड़ोसी इंटरैक्शन का विश्लेषण और मात्रा निर्धारित करने में भी सक्षम करेगा।

सॉफ्टवेयर में एक आकृति बनाने वाला उपकरण शामिल है जो संदर्भ फ्रेम और स्केल बार सहित प्रकाशन योग्य प्रारूपों में छवियों की बहु-पैनल तस्वीरें बना सकता है

मात्रात्मक परिणाम छवि

यह आंकड़ा स्तन कैंसर में Ki67 के लिए धुंधलापन की मात्रा को दर्शाता है। शीर्ष बायां पैनल ऊतक माइक्रोएरे नमूना दिखाता है, मध्य पैनल HALO मार्कअप के बिना Ki67 धुंधला (भूरा) दिखाता है और दायां पैनल HALO मार्कअप के साथ समान छवि दिखाता है।

मार्कअप ट्यूमर कोशिकाओं के नाभिक में निम्न स्तर का धुंधला (पीला), मध्यम धुंधला (भूरा) और उच्च स्तर (लाल) Ki67 दिखाता है। ब्लू स्टेनिंग वे कोशिकाएं हैं जो Ki67 के लिए नकारात्मक हैं। सॉफ्टवेयर स्वतंत्र रूप से ट्यूमर के रंध्र में Ki67 धुंधला होने की गणना कर सकता है।

तालिका प्रत्येक धुंधला श्रेणी में कोशिकाओं की संख्या और प्रतिशत का रीड आउट दिखाती है और हिस्टोग्राम धुंधला के वितरण को दर्शाता है।

नमूनों के लिए आवेदन कैसे करें

Contact कैथी मार्टिनेज or सैडी ला बाउवे शेड्यूल करने के लिए।

आईलैब में अपना खाता खोलें:

  1. पर नेविगेट करें आईलैब्स लॉगिन पेज.
  2. स्क्रीन के ऊपरी दाएं कोने में, चुनें साइन अप करें
  3. साइन-अप पेज पर पंजीकरण फॉर्म को पूरा करें।
  4. लॉगिन क्रेडेंशियल और निर्देशों के साथ iLab से एक स्वागत ईमेल प्राप्त करें

आईलैब में सेवाओं का अनुरोध करना:

  1. अपने विभाग के माध्यम से एक खरीद अनुरोध (पीआर) स्थापित करें। पीआर को ईमेल करें मैरी शर्मन इसे iLab सिस्टम में आपकी प्रयोगशाला के अंतर्गत जोड़ने का अनुरोध करना।
  2. इस पर जाएँ आईलैब्स लॉगिन इस पृष्ठ पर ज़ूम कई वीडियो ट्यूटोरियल और अन्य साहायक साधन प्रदान करता है।
  3. इस पृष्ठ के ऊपरी दाएं कोने में, अपना उपयोगकर्ता नाम और पासवर्ड दर्ज करें।
  4. "अनुरोध सेवाएं" टैब के तहत, ब्याज की सेवा (मानव ऊतक रिपोजिटरी बनाम आण्विक पैथोलॉजी सेवाएं) के आगे "आरंभ करें अनुरोध" पर क्लिक करें।
  5. एचटीआर को अनुरोध सबमिट करने से पहले फ़ॉर्म को पूरा करें और अपने अनुरोध के लिए भुगतान जानकारी प्रदान करें।
    1. सुनिश्चित करें कि प्रोजेक्ट टाइटल और TROC/HRRC/IACUC नंबर आपके अनुमोदन पत्रों से मेल खाते हैं।
    2. सेवाओं की प्रत्येक श्रेणी के तहत, वांछित संख्या दर्ज करें और "चयनित सेवाएं जोड़ें" टैब पर क्लिक करें। फॉर्म के नीचे सेवाएं जोड़ी जाएंगी।
    3. किसी भी महत्वपूर्ण विवरण को जोड़ने के लिए "अतिरिक्त जानकारी" बॉक्स का उपयोग करें, और कोई भी प्रासंगिक दस्तावेज संलग्न/अपलोड करें, जैसे नमूना सूची या अभिविन्यास विवरण।
  6. अनुरोध HTR द्वारा समीक्षा के लिए लंबित रहेंगे, जो कोई भी आवश्यक परिवर्तन करेगा और आपकी स्वीकृति के लिए वापस सबमिट करेगा। आपको अपने अपडेट किए गए प्रोजेक्ट अनुरोध के संबंध में iLab से एक ईमेल प्राप्त होगा।
  1. ऊतक अनुसंधान निरीक्षण समिति (TROC) को अपना प्रस्ताव जमा करें। कैसेंड्रा मिसेनार से संपर्क करें इस प्रक्रिया में मार्गदर्शन के लिए।
  2. एक बार जब TROC आपके प्रस्ताव को मंजूरी दे देता है, तो UNM को अपने आवेदन के साथ अनुमोदन पत्र भेजें मानव अनुसंधान समीक्षा समिति (एचआरआरसी) संस्थागत समीक्षा बोर्ड (आईआरबी).

आईआरबी आवेदन प्रक्रिया को नेविगेट करने के लिए:

  1. उपरोक्त लिंक पर, बाईं ओर "IRB पर क्लिक करें" बटन पर क्लिक करें
  2. स्क्रीन के शीर्ष पर आईआरबी टैब पर क्लिक करें
  3. बाईं ओर "नया अध्ययन बनाएं" बटन पर क्लिक करें
  4. फॉर्म को भरें
  5. प्रश्न #7 पर, पुस्तकालय जाने के लिए लिंक पर क्लिक करें और अपने अध्ययन के लिए उपयुक्त प्रोटोकॉल का चयन करें
    1. यदि आपके अध्ययन के लिए केवल गैर-पहचान सामग्री की आवश्यकता है तो छूट श्रेणी 4 प्रोटोकॉल (एचआरपी-582) का चयन करें। *नोट: गैर-पहचाने गए डिस्कार्ड ऊतकों को सहमति की आवश्यकता नहीं हो सकती है
    2. यदि आपके अध्ययन के लिए जीवित व्यक्तियों के बारे में कोई जानकारी प्राप्त करने की आवश्यकता नहीं है, तो अमानवीय विषय अनुसंधान (HRP-585) का चयन करें।
    3. यदि आपके अध्ययन में केवल ऐसे नमूने शामिल हैं जो केवल गैर-अनुसंधान उद्देश्यों (जैसे चिकित्सा उपचार और निदान) के लिए एकत्र किए गए हैं, तो आप शीघ्र प्रस्तुतीकरण के लिए प्रस्तुत कर सकते हैं।
  6. HRRC अनुमोदन के बाद, iLab के माध्यम से HTR को एक ऊतक अनुरोध सबमिट करें। आप अपने एसआरसी और आईआरबी अनुमोदन पत्र अपलोड करेंगे, और सिस्टम में एक सक्रिय पीआर होगा।
  1. योजना/व्यवहार्यता सत्र के लिए एचटीआर-टीएएसआर से संपर्क करें।
  2. ऊतक अनुसंधान निरीक्षण समिति (TROC) को अपना प्रस्ताव जमा करें। कैसेंड्रा मिसेनार से संपर्क करें इस प्रक्रिया पर मार्गदर्शन के लिए।
  3. एक बार टीआरओसी ने आपके प्रस्ताव को मंजूरी दे दी है, तो अपने आवेदन के साथ यूएनएम मानव अनुसंधान समीक्षा समिति (एचआरआरसी) संस्थागत समीक्षा बोर्ड (आईआरबी) को अनुमोदन पत्र भेजें (ऊपर निर्देश देखें)।
  4. अतिरिक्त नियोजन सत्र के लिए एचटीआर-टीएएसआर से संपर्क करें (आमतौर पर प्रक्रिया के विवरण को स्पष्ट करने के लिए आवश्यक है। इस बैठक में राष्ट्रीय प्रयोगशाला नियमों और सर्वोत्तम रोगी देखभाल के अनुपालन को बनाए रखते हुए नमूनों की उपलब्धता सुनिश्चित करने के लिए सर्जिकल पैथोलॉजी के डिवीजन चीफ से अनुमोदन प्राप्त करना शामिल है।
  5. यदि आपकी जांच समाप्त होने के बाद आपके पास ऊतक शेष है, तो आपको इसे एचटीआर . को वापस करना होगा
  1. यदि एकत्रित ऊतक के किसी भी हिस्से का संभावित रूप से अनुसंधान के लिए उपयोग किया जा सकता है, तो आपको स्थानीय मानव अनुसंधान समीक्षा समिति से अनुमोदन प्राप्त करना होगा।
  2. सर्जिकल पैथोलॉजी के डिवीजन चीफ या उनके नामिती को नमूना संग्रह की विधि को मंजूरी देनी चाहिए ताकि यह सुनिश्चित हो सके कि नैदानिक ​​​​देखभाल के लिए पर्याप्त प्रतिनिधि ऊतक बनाए रखा गया है।

इन्वेंटरी

एकत्रित ऊतकों की साइट

(यूएनएम से अभिलेखीय ऊतक और विशिष्ट अध्ययनों के लिए जांचकर्ताओं के लिए संभावित संग्रह शामिल हैं।)

  • ब्लैडर, ब्लड, बोन, बोन मैरो, ब्रेन, ब्रेस्ट
  • छाती की दीवार, कोलोरेक्टल
  • डायाफ्राम
  • पित्ताशय
  • सर और गर्दन
  • गुर्दा
  • जिगर, फेफड़े, लिम्फ नोड
  • मध्यस्थानिका
  • ओमेंटम, अंडाशय
  • अग्न्याशय, लिंग, पेरिटोनियम, प्रोस्टेट
  • लार, लार ग्रंथि, त्वचा, छोटी आंत, कोमल ऊतक, प्लीहा, पेट
  • वृषण, थाइमस, थायराइड
  • गर्भाशय और गर्भाशय ग्रीवा
  • योनि/वल्वा

विस्तारित स्तन कैंसर रजिस्ट्री (EBCR)

यह एक जटिल ऊतक संग्रह है जिसमें कई समय बिंदुओं और एकत्रित ऊतक के प्रकार के साथ 400 से अधिक सहमति वाले रोगी शामिल हैं। प्रत्येक रोगी पर निम्नलिखित एकत्र किए गए थे:

  • 5 सीरम एलिकोट्स अधिकतम/प्रतिभागी/संग्रह (जैसे बेसलाइन या एफयूपी समय)
  • 10 प्लाज्मा aliquots अधिकतम/प्रतिभागी/संग्रह
  • संपूर्ण रक्त/प्रतिभागी/संग्रह से १० डीएनए विभाज्य
  • माउथवॉश या स्वैब/प्रतिभागी/संग्रह से अधिकतम 2 डीएनए एलिकोट्स
  • स्तन ऊतक (ठीक सुई एस्पिरेट्स, शीशियां और ओसीटी मोल्ड) - सभी मामले अलग हैं।

इस डेटासेट की अधिक विस्तृत क्वेरी के लिए कृपया HTR-TASR से संपर्क करें।