विश्लेषणात्मक और अनुवादक जीनोमिक्स
एटीजी यूएनएम और संबद्ध संस्थानों के सभी शोधकर्ताओं द्वारा उपयोग के लिए उपलब्ध है।
इस साझा संसाधन के उपयोग को स्वीकार करने के लिए, कृपया अपने प्रकाशनों में निम्नलिखित शामिल करें:
इस शोध को आंशिक रूप से UNM कॉम्प्रिहेंसिव कैंसर सेंटर सपोर्ट ग्रांट NCI P30CA118100 द्वारा समर्थित किया गया था और एनालिटिकल एंड ट्रांसलेशनल जीनोमिक्स शेयर्ड रिसोर्स का उपयोग किया गया था, जिसे न्यू मैक्सिको राज्य से अतिरिक्त समर्थन प्राप्त होता है।
एटीजी सेवाओं को नीचे और अधिक विस्तार से वर्णित किया गया है।
RSI विश्लेषणात्मक और अनुवादक जीनोमिक्स संसाधन मुख्य रूप से अगली पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीकें प्रदान करता है जैसे कि RNA-seq, लक्षित जीन पैनल अनुक्रमण और एपिजेनेटिक्स assays जैसे Chip-seq और ATAC-seq, विशेषज्ञ जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण के साथ युग्मित। रीयल-टाइम पीसीआर सेवाएं भी उपलब्ध हैं। एटीजी साझा संसाधन यूएनएम और उसके सहयोगियों में सभी संकाय द्वारा उपयोग के लिए उपलब्ध है, और सभी जांचकर्ताओं को यह पता लगाने के लिए हमसे संपर्क करने के लिए प्रोत्साहित किया जाता है कि हम उनके शोध में कैसे मदद कर सकते हैं।
10x जीनोमिक्स सिंगल-सेल सीक्वेंसिंग: अत्याधुनिक एकल-कोशिका अनुक्रमण 10x जीनोमिक्स प्रणाली का उपयोग करके पेश किया जाता है, जो या तो जीवित कोशिकाओं के साथ या जमे हुए नमूनों से पृथक नाभिक के साथ अच्छी तरह से काम करता है।
एकवचन जीनोमिक्स G4 पेयर-एंड सीक्वेंसिंग: RNA-seq, Chip-seq, संपूर्ण Exome अनुक्रमण (WES) या संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण (WGS) सहित सभी प्रकार की अगली पीढ़ी के अनुक्रमण के लिए एक लचीला और तीव्र अनुक्रमण उपकरण। इल्लुमिना सीक्वेंसिंग के लिए तैयार किए गए अधिकांश पुस्तकालयों को G4 पर विश्लेषण के लिए जल्दी और कुशलता से परिवर्तित किया जा सकता है।
इल्लुमिना अनुक्रमण: ATG का CO, Anschutz के Univ में जीनोमिक्स कोर के साथ उनके NovaSeq इंस्ट्रूमेंट का उपयोग करके इलुमिना सीक्वेंसिंग के लिए एक अनुबंध है। एटीजी पुस्तकालयों को तैयार कर सकता है और उन्हें सीक्वेंसिंग के लिए यूओएफसीओ को भेज सकता है, या लाइब्रेरी प्रेप और सीक्वेंसिंग के लिए वहां नमूने भेज सकता है। बाद में, डेटा विश्लेषण के लिए डेटा को हमारे AWS वेब खाते में अपलोड किया जाता है।
आयन टोरेंट नेक्स्ट-जेनेरेशन सीक्वेंसिंग: शक्तिशाली लाइफ टेक्नोलॉजीज आयन प्रोटॉन एस5/एक्सएल सेमीकंडक्टर सीक्वेंसिंग इंस्ट्रूमेंट अगली पीढ़ी की सीक्वेंसिंग जांच के लिए आदर्श हैं, जिसमें जीन एक्सप्रेशन (आरएनए-सीक्यू) एसेज़, एपिजेनेटिक्स एसेज़ (चिप-सीक) और कैंसर के टारगेटेड सीक्वेंसिंग (आयन एम्पलीसेक कॉम्प्रिहेंसिव कैंसर पैनल) शामिल हैं। प्रासंगिक जीन, FFPE नमूनों से भी।
विशेषज्ञ जैव सूचना विज्ञान डेटा विश्लेषण: एटीजी साझा संसाधन कर्मचारी जीन अभिव्यक्ति और जीनोटाइपिंग डेटा का विश्लेषण करने के लिए परिष्कृत डेटा विश्लेषण विधियों का उपयोग करते हैं और हमारे उपयोगकर्ताओं को उनकी पांडुलिपियों या अनुदान अनुप्रयोगों के लिए प्रकाशन-गुणवत्ता के आंकड़े प्रदान करने का प्रयास करते हैं। हम जीनोमिक्स विधियों द्वारा उत्पन्न बड़े और जटिल डेटा सेट का पता लगाने के लिए R/Bioconductor सॉफ़्टवेयर पैकेज का उपयोग करते हैं।
अगली पीढ़ी के अनुक्रमण के अनुप्रयोग
अगली पीढ़ी (बड़े पैमाने पर समानांतर) अनुक्रमण विभिन्न प्रयोगात्मक दृष्टिकोणों के लिए उपयोगी है। यह प्लास्मिड या पीसीआर उत्पादों के सामान्य (सेंगर) अनुक्रमण के लिए एक प्रतिस्थापन नहीं है। इसके बजाय, अगली-जीन अनुक्रमण लाखों या अरबों व्यक्तिगत डीएनए अणुओं (जैसे जीनोमिक डीएनए टुकड़े, सीडीएनए) को कैप्चर करने पर निर्भर करता है, जो तब अलग-अलग प्रवर्धित होते हैं और समानांतर में अनुक्रमित होते हैं, लाखों या अरबों अनुक्रमण "रीड्स" उत्पन्न करते हैं, जिनमें से प्रत्येक की उत्पत्ति हुई एक अलग टेम्पलेट अणु। यह व्यक्तिगत रूप से लाखों या अरबों स्वतंत्र डीएनए अंशों की क्लोनिंग और अनुक्रमण के समान है, लेकिन यह सब एक ही बार में और कुछ ही दिनों में होता है।
निम्नलिखित प्रकार के वैज्ञानिक अनुप्रयोग अगली पीढ़ी के अनुक्रमण दृष्टिकोणों के लिए आसानी से अनुकूलनीय हैं:
- कैंसर के लक्षित जीन पैनल अनुक्रमण- या रोग-संबंधी जीन
- RNA-seq . का उपयोग करके जीन अभिव्यक्ति अध्ययन
- क्रोमैटिन इम्यूनोप्रूवमेंट - प्रतिलेखन कारक या एपिजेनेटिक अध्ययन के लिए अनुक्रमण (चिप-सीक)
- डीएनए मिथाइलेशन अध्ययन (जैसे आरआरबीएस)
- ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण (उदाहरण के लिए वैकल्पिक रूप से मसालेदार आरएनए की पहचान)
- गैर-कोडिंग RNAs का विश्लेषण (ncRNAs, lincRNAs, miRs)
एटीजी सुविधा के पास वर्तमान में कई प्रकार के अगली पीढ़ी के अनुक्रमण उपकरणों तक पहुंच है या है:
- एकवचन जीनोमिक्स G4: रैपिड और फ्लेक्सिबल पेयर-एंड सीक्वेंसिंग (इलुमिना नेक्स्टसेक के समान)
- थर्मोफिशर आयन S5/XL: सॉलिड स्टेट एनजीएस प्रति चिप 120 मिलियन तक पढ़ता है
- इल्लुमिना अनुक्रमण (नोवासेक और नेक्स्टसेक) हमारे भागीदारों के माध्यम से सीओ के विश्वविद्यालय, Anschutz
- 10x जीनोमिक्स क्रोमियम नियंत्रक: एकल-कोशिका RNA-seq और ATAC-seq assays के लिए
ये उपकरण सभी प्रकार की अगली पीढ़ी की अनुक्रमण जांच के लिए किफायती और तीव्र अगली पीढ़ी की अनुक्रमण प्रदान करते हैं।
साझा साधन उपलब्ध सोमवार-शुक्र 8:30 पूर्वाह्न - 5 अपराह्न
(अन्य समय विशेष व्यवस्था द्वारा उपलब्ध हो सकता है)
एटीजी में कई अनूठे उपकरण हैं जिन्हें यूएनएम के शोधकर्ता उपयोग करने की व्यवस्था कर सकते हैं। योग्य प्रयोगशालाएं वार्षिक उपयोगकर्ता शुल्क का भुगतान करती हैं और एटीजी स्टाफ से प्रशिक्षण और सहायता प्राप्त करती हैं। उपकरण सामान्य कामकाजी घंटों के दौरान सुविधा में उपयोग के लिए उपलब्ध हैं।
एगिलेंट बायोएनालिज़र: आणविक जीवविज्ञानी के लिए एक महत्वपूर्ण उपकरण, कई प्रकार के अनुप्रयोगों के लिए जेल वैद्युतकणसंचलन की जगह लेता है। यह एक जेल पर बड़ी मात्रा में कीमती नमूने चलाने के बजाय, बहुत कम मात्रा में सामग्री का उपयोग करके आरएनए या डीएनए नमूनों की गुणवत्ता और/या मात्रा का विश्लेषण करने के लिए विशेष रूप से उपयोगी है।
नैनोड्रॉप स्पेक्ट्रोफोटोमीटर: एक छोटी बूंद स्पेक्ट्रोफोटोमीटर जो नमूने की एक छोटी बूंद में अवशोषण को मापता है। यह बड़े क्यूवेट्स में नमूनों को पतला करने की आवश्यकता से बचा जाता है।
थर्मो फिशर सेल कूटेस II: एक नमूने में जीवित कोशिकाओं की मात्रा निर्धारित करने के लिए।
मिल्टनी जेंटलएमएसीएस ऑक्टो डिसोसिएटर हीटर के साथ: अनुक्रमण से पहले ऊतक के नमूनों को अलग करने के लिए।
क्यूबिट फ्लोरोमीटर: आरएनए और डीएनए की मात्रा का ठहराव के लिए
परख और मूल्य निर्धारण के बारे में अधिक जानकारी के लिए कृपया एटीजी सुविधा कर्मचारियों से संपर्क करें।
के लिए हमारी iLab साइट का उपयोग करें आरक्षण और उद्धरण. (लॉगिन आवश्यक)
विश्लेषणात्मक और अनुवादक जीनोमिक्स (एटीजी) साझा संसाधन (पूर्व में केक-यूएनएम जीनोमिक्स संसाधन, केयूजीआर) विशेषज्ञ जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण के साथ अगली पीढ़ी के अनुक्रमण परख, माइक्रोएरे और अन्य जीनोमिक्स प्रौद्योगिकियों तक पहुंच प्रदान करता है। एटीजी यूएनएम और उसके सहयोगियों में सभी संकाय द्वारा उपयोग के लिए उपलब्ध है, और सभी जांचकर्ताओं को यह पता लगाने के लिए एटीजी से संपर्क करने के लिए प्रोत्साहित किया जाता है कि हम उनके शोध में कैसे मदद कर सकते हैं।
से संबंधित प्रश्नों के लिए आईलैब्स या साझा संसाधन में उपयोग के लिए खाते/पीआर सेट-अप के लिए, कृप्या अ ईमेल मैरी शर्मन या 505-272-4539 पर कॉल करें।
भरना यह स्मार्टशीट फॉर्म अपनी परियोजना शुरू करने के लिए।
(फॉर्म एक नए टैब में खुलेगा। अगर ऐसा नहीं होता है, तो इस टेक्स्ट को कॉपी करें और अपने ब्राउज़र में एक नए टैब के एड्रेस बार में पेस्ट करें: https://app.smartsheet.com/b/form/fa518ed260454445bec9d3bc34cac4cf)
एटीजी अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
एटीजी साझा संसाधन से अगली पीढ़ी की अनुक्रमण (एनजीएस) सेवाओं के उपयोग पर विचार करने वाले शोधकर्ताओं के लिए ये दिशानिर्देश हैं। सभी शोधकर्ताओं से नमूने तैयार करने या उनका विश्लेषण करने से पहले एटीजी कर्मचारियों से परामर्श करने का आग्रह किया जाता है। हम प्रयोगात्मक डिजाइन में सहायता कर सकते हैं और, यदि आवश्यक हो, तो आपको विशेषज्ञ जैव सांख्यिकीविदों के संपर्क में रख सकते हैं जो प्रयोगात्मक डिजाइन में मदद कर सकते हैं। एनजीएस प्रयोग शुरू करने से पहले प्रायोगिक डिजाइन पर विचार करना बहुत जरूरी है, जो काफी महंगा हो सकता है।
RNA-seq को बहुत कम मात्रा में RNA के साथ सफलतापूर्वक निष्पादित किया जा सकता है। हालांकि, आवश्यक राशि आवश्यक "रीड डेप्थ" पर निर्भर करती है और क्या राइबोसोमल आरएनए संदूषण होगा। राइबोसोमल आरएनए कोशिकाओं में आरएनए का 90% है, इसलिए आरएनए-सीक्यू करने से पहले राइबोसोमल आरएनए को हटाना या कम करना आवश्यक है। ऐसा करने के दो तरीके हैं, "रिबोडेप्लेशन" के माध्यम से शारीरिक निष्कासन, जिसमें राइबोसोमल आरएनए के पूरक बायोटिनाइलेटेड जांच को आरएनए नमूनों के साथ संकरणित किया जाता है, फिर परिसरों को पकड़ लिया जाता है और हटा दिया जाता है। वैकल्पिक रूप से, एक पॉली-ए-निर्देशित पुस्तकालय प्रस्तुत करने का तरीका (जैसे स्मार्ट-सेक) का उपयोग किया जा सकता है जो राइबोसोमल आरएनए को अनुक्रमित करने से बचता है, लेकिन इसमें अन्य आरएनए शामिल नहीं होते हैं जिनमें पॉलीए पूंछ की कमी होती है और यह ब्याज की हो सकती है (जैसे माइक्रोआरएनए)। प्रयोग शुरू करने से पहले विकल्पों पर चर्चा करने के लिए कृपया एटीजी साझा संसाधन स्टाफ से संपर्क करें।
एटीजी साझा संसाधन पूर्ण सेवा एनजीएस विश्लेषण करता है। हालांकि, एनजीएस पुस्तकालय की तैयारी की जटिलताओं के कारण, एटीजी क्या प्रदान कर सकता है यह प्रयोग के प्रकार पर निर्भर करता है। लक्षित पैनल अनुक्रमण और एक्सोम अनुक्रमण के लिए, हमें केवल डीएनए नमूनों की आवश्यकता है और हम पुस्तकालयों का निर्माण करेंगे, अनुक्रमण और प्रारंभिक विश्लेषण करेंगे। हम काम शुरू करने से पहले अपेक्षित लागत के लिए एक उद्धरण प्रदान करेंगे। RNA-seq और अन्य दृष्टिकोणों के लिए, पुस्तकालयों के निर्माण के तरीके में कई भिन्नताएँ हैं। हम उपयोगकर्ताओं से आग्रह करते हैं कि शुरुआत से पहले विकल्पों पर चर्चा करने के लिए एटीजी स्टाफ से संपर्क करें। संपूर्ण एफिमेट्रिक्स सिस्टम के अलावा, एटीजी साझा संसाधन में आरएनए को छोटी मात्रा में मापने के लिए एक नैनोड्रॉप स्पेक्ट्रोमीटर है, और आरएनए या डीएनए नमूनों की गुणवत्ता और मात्रा का तेजी से विश्लेषण करने के लिए एक एगिलेंट बायोएनालिज़र है।
एनजीएस प्रयोग महंगे हो सकते हैं। अधिकांश बड़े प्रयोगों (एक्सोम सीक्वेंसिंग, आरएनए-सीक्यू, आदि) की कुल लागत $500 से $800 प्रति नमूना है, साथ ही जैव सूचना विज्ञान के लिए एक शुल्क है। कुछ छोटे लक्षित अनुक्रमण प्रयोगों की लागत प्रति नमूना कम होती है। अधिक जानकारी के लिए और उद्धरण प्राप्त करने के लिए कृपया कर्मचारियों से संपर्क करें।
हाँ! NGS प्रयोग बड़े, जटिल डेटा सेट उत्पन्न करते हैं। डुप्लीकेट के बिना जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण संभव नहीं है। ट्रिपलेट बेहतर हैं। अच्छे परिणाम प्राप्त करने के लिए प्रतिकृतियां वास्तव में आवश्यक हैं जो सार्थक और लागत के लायक हैं।
ATG साझा संसाधन यह सुनिश्चित करने के लिए सख्त गुणवत्ता नियंत्रण दिशानिर्देशों और मानक संचालन प्रक्रियाओं का पालन करता है कि डेटा उच्चतम गुणवत्ता का है और ENCODE संघ जैसे समूहों द्वारा निर्धारित मानकों को पूरा करता है या उससे अधिक है। हम आंतरिक प्रक्रियाओं की निगरानी के लिए मानक स्पाइक-इन नियंत्रणों का उपयोग करते हैं और पुस्तकालय उत्पादन और अनुक्रमण के हर चरण में गुणवत्ता नियंत्रण जांच करते हैं। हमारे द्वारा सफलतापूर्वक तैयार किए गए डेटा के उदाहरण देखने के लिए कृपया एटीजी स्टाफ से संपर्क करें।
प्रारंभिक आरएनए नमूनों की गुणवत्ता की पुष्टि एगिलेंट बायोएनालाइजर का उपयोग करके या रीयल-टाइम पीसीआर का उपयोग करके की जाएगी। अनुक्रमण से पहले पुस्तकालयों की इसी तरह जाँच की जाएगी। आंतरिक गुणवत्ता नियंत्रण की निगरानी के लिए कई चरणों में स्पाइक-इन नियंत्रण जोड़े जाते हैं।
NGS assays बड़े, जटिल डेटा सेट का उत्पादन करते हैं जिनमें भारी मात्रा में जानकारी होती है, लेकिन इसका विश्लेषण करना भी मुश्किल हो सकता है। एटीजी साझा संसाधन विश्लेषण का पहला स्तर प्रदान करता है, जिसमें गुणवत्ता नियंत्रण मापदंडों का विश्लेषण, उपयुक्त जीनोम के लिए रीड का संरेखण, अनुक्रम वेरिएंट या फीचर काउंट की पहचान करना, जैसा कि उपयुक्त हो, और सीधे प्रकार की व्याख्या करना, जैसे कि हीटमैप का उत्पादन आरएनए-सीक के लिए। हालांकि, अधिक जटिल प्रकार के डेटा विश्लेषण, जैसे कि रोगी की जानकारी से संबंधित परिणाम, जैव सूचना विज्ञान साझा संसाधन या बायोस्टैटिस्टिक्स साझा संसाधन के विशेषज्ञों के इनपुट के साथ किए जाने चाहिए। एटीजी स्टाफ उपयुक्त विशेषज्ञों के साथ बातचीत स्थापित करने में मदद कर सकता है, जिन्हें प्रयोगात्मक डिजाइन और गुणवत्ता नियंत्रण में मदद करने के लिए शुरुआत से ही शामिल होना चाहिए।
ऐसी संभावना है कि एनजीएस डेटा उत्पन्न करने में शामिल जटिल प्रक्रिया एक "दिन प्रभाव" या "बैच प्रभाव" उत्पन्न करेगी, जिसमें नमूने एक ही डेटा क्लस्टर पर एक साथ संसाधित या विश्लेषण किए जाते हैं। यह उच्च-आयामी डेटा विश्लेषण का एक प्रसिद्ध आर्टिफैक्ट है, और हम इस प्रकार की डेटा समस्याओं की पहचान करने और उन्हें दूर करने में मदद करने के लिए स्पाइक-इन नियंत्रण शामिल करते हैं।
एटीजी साझा संसाधन में जैव सूचना विज्ञान विशेषज्ञों की एक टीम है जो प्रारंभिक डेटा विश्लेषण करेगी और जो डेटा का प्रबंधन और बैकअप करेगी। वे सबसे सरल प्रकार के विश्लेषण कर सकते हैं (जैसे RNA-seq से जीन अभिव्यक्ति)। हालांकि, जटिल या अनुकूलित प्रकार के विश्लेषणों के लिए बायोस्टैटिस्टिक्स या जैव सूचना विज्ञान साझा संसाधनों के अतिरिक्त विशेषज्ञों से इनपुट की आवश्यकता होगी। एटीजी कर्मचारी आवश्यक सहयोग स्थापित करने में मदद कर सकते हैं।
सत्यापन प्रत्येक एनजीएस प्रयोग का एक महत्वपूर्ण हिस्सा है, और प्रयोग के प्रकार के आधार पर आवश्यकताएं भिन्न होती हैं। एनजीएस परिणामों के सत्यापन के विकल्पों पर चर्चा करने के लिए कृपया एटीजी स्टाफ से संपर्क करें।
सुविधा निदेशक, स्कॉट ए. नेस, पीएच.डी., अनुदान आवेदनों में एटीजी साझा संसाधन और संभावित एनजीएस प्रयोगों का वर्णन करने के तरीके के बारे में समर्थन और सलाह के पत्र प्रदान कर सकता है। डॉ नेस ने कई एनआईएच, एसीएस और डीओडी अध्ययन अनुभागों में काम किया है और कई अनुदान आवेदनों की समीक्षा की है जिसमें एनजीएस प्रयोग शामिल हैं। उनके अपने वित्त पोषित अनुदानों में एनजीएस प्रयोग हैं। वह एनजीएस प्रयोगों के संबंध में आपके अनुदान के अनुभागों को लिखने में सहायता प्रदान कर सकता है और संभावित नुकसान और बचने के लिए चीजों को इंगित कर सकता है।
एनजीएस प्रयोग की आलोचना करने का सबसे आसान तरीका यह है कि इसे मछली पकड़ने के अभियान के रूप में वर्णित किया जाए। यहां कुछ चीजें हैं जिनसे आपको निश्चित रूप से बचना चाहिए।
- उन जीनों को चिह्नित करने का प्रस्ताव न करें जिन्हें आपने अभी तक पहचाना नहीं है। यदि आपके पास कोई प्रारंभिक डेटा नहीं है, तो आप नहीं जानते कि आपको कौन से जीन या कितने जीन मिलेंगे। हालांकि इनकी संख्या सैकड़ों में होने की संभावना है। केवल यह कहना कि आप अध्ययन के लिए कुछ दिलचस्प जीन चुनेंगे, आपके अनुदान पर खराब अंक प्राप्त करने का एक त्वरित तरीका है। यदि संभव हो, तो आपके प्रयोग को एक परिकल्पना का परीक्षण करना चाहिए। उदाहरण के लिए, आप यह परिकल्पना कर सकते हैं कि कुछ जीन (जैसे एपोप्टोसिस जीन) प्रेरित होंगे। फिर आप इसका परीक्षण करने के लिए NGS assays का उपयोग करने का प्रस्ताव कर सकते हैं (और वास्तविक समय पीसीआर को बैक-अप दृष्टिकोण के रूप में प्रस्तावित कर सकते हैं)। इस तरह आप एक परिकल्पना का परीक्षण कर सकते हैं, अपेक्षित परिणामों और नियंत्रणों का प्रस्ताव कर सकते हैं (उदाहरण के लिए जीन जो ऊपर और नीचे जाना चाहिए), जो कि एनजीएस प्रयोग (या कोई अन्य प्रयोग) करने का एक बेहतर तरीका है। बस जीन के लिए मछली पकड़ना एक बुरा तरीका है और हमेशा समीक्षा समिति का गुस्सा खींचता है।
- केवल यह कहना कि आप डेटा का विश्लेषण करने के लिए कुछ सॉफ़्टवेयर प्रोग्राम का उपयोग करेंगे या जीन को पाथवे में समूहित करेंगे, भी आपको परेशानी में डालने वाला है। एनजीएस डेटा अत्यंत जटिल हो सकता है, और विश्लेषण के लिए सांख्यिकीय विधियों की आवश्यकता होगी। पाथवे डेटा जो ज्ञात है वह अत्यंत अपूर्ण है। वैसे भी अधिकांश जीन रास्ते में नहीं होते हैं। डेटा के विश्लेषण के लिए आपको एक सुनियोजित दृष्टिकोण की आवश्यकता होगी। आपके पास यह बताने का एक तरीका होना चाहिए कि प्रयोग ने काम किया या नहीं (उदाहरण के लिए अपेक्षित एपोप्टोसिस जीन सक्रिय हो गए?)
- NGS प्रयोग आपके किसी एक उद्देश्य के अंत में केवल एक अनुच्छेद नहीं होना चाहिए। आप जो कुछ भी करते हैं, अनुदान आवेदन के अंत में एक एनजीएस प्रयोग बिल्कुल न जोड़ें जैसा कि आप "भी करेंगे"। एनजीएस प्रयोग बड़े, महंगे और जटिल हैं और उन्हें बाद में सोचकर नहीं किया जा सकता है। कई, कई अनुदानों में एनजीएस प्रयोग का एक-पैरा विवरण होता है जो शोधकर्ता भी करेंगे। यह समीक्षकों की आलोचना के लिए बिजली की छड़ी है।
- यदि आप जीन की तलाश में हैं, तो आपको किसी कारण से उनकी तलाश करनी चाहिए। उनके साथ कुछ करने का प्रस्ताव किए बिना विनियमित जीन की तलाश करने का प्रस्ताव न करें। ऊपर और नीचे जाने वाले जीनों को खोजना एक महत्वपूर्ण पर्याप्त लक्ष्य नहीं है। आपको किसी उद्देश्य को ध्यान में रखते हुए जीन की तलाश करने की आवश्यकता है (उदाहरण के लिए कुछ परिकल्पना का परीक्षण किया जाना है)।