विश्लेषणात्मक और अनुवादक जीनोमिक्स

विश्लेषणात्मक और अनुवादक जीनोमिक्स (एटीजी) साझा संसाधन यूएनएम और संबद्ध संस्थानों में यूएनएम कैंसर केंद्र के सदस्यों और अन्य उपयोगकर्ताओं को अगली पीढ़ी के अनुक्रमण और अन्य जीनोमिक्स से संबंधित सेवाएं प्रदान करता है। प्राथमिक सेवाओं में दो आयन प्रोटॉन S5/XL उपकरणों और संबंधित विशेषज्ञ जैव सूचना विज्ञान समर्थन का उपयोग करते हुए अगली पीढ़ी की अनुक्रमण शामिल है। इनमें नियमित 'बल्क' RNA-seq, 10x जीनोमिक्स सिस्टम का उपयोग करके एकल-कोशिका RNA-seq, लक्षित DNA अनुक्रमण, Chip-seq और कई अन्य परख शामिल हैं, जिनमें से कई जीवित या जमे हुए कोशिकाओं या ऊतक के साथ किए जा सकते हैं। या संग्रहीत (जैसे FFPE) नमूने। सिंगुलर जीनोमिक्स G4 सीक्वेंसर सभी प्रकार के RNA-seq और DNA-seq assays के लिए उपयुक्त एक लचीले और तीव्र प्रारूप में अगली पीढ़ी की अनुक्रमण प्रदान करता है। आयन प्रोटोन एस5/एक्सएल उपकरण विशेष रूप से खराब गुणवत्ता वाले आरएनए के विश्लेषण के लिए अनुकूल हैं, उदाहरण के लिए एफएफपीई सामग्री से, जो अन्य तकनीकों का उपयोग करके विश्लेषण करना मुश्किल या असंभव है। उपकरण प्रति अनुक्रमण चिप 100 मिलियन तक पढ़ते हैं, और यदि संभव हो तो हम त्वरित बदलाव प्रदान करने का प्रयास करते हैं।

साझा संसाधन UNM कैंसर केंद्र द्वारा समर्थित है, जिसमें CCSG कोर अनुदान P30CA118100 और अन्य फंड शामिल हैं, साथ ही साथ NM राज्य और उपयोगकर्ता शुल्क के फंड भी शामिल हैं।

विशेषज्ञ कर्मचारी परामर्श के लिए उपलब्ध हैं ताकि उपयोगकर्ताओं को सर्वोत्तम संभव प्रयोगों को डिजाइन करने में मदद मिल सके, ताकि उत्पादित डेटा की गुणवत्ता को अधिकतम किया जा सके।

डॉ. नेस (बाएं) और जीनोमिक्स स्टाफ

संकाय निदेशक

स्कॉट ए नेस, पीएच.डी.
शिक्षक, आंतरिक चिकित्सा/आणविक चिकित्सा
कार्यालय: सीआरएफ 121; दूरभाष: (505) 272-9883

तकनीकी निदेशक / जैव सूचना विज्ञान

कैथरीन (चार्ली) ब्रेयर, पीएचडी;

वरिष्ठ तकनीकी कर्मचारी

केल कुक सीआरएफ 118 दूरभाष: (505) 272-5564
जेनिफर वुड्स सीआरएफ 121 दूरभाष: (505) 272-3464
मैगी साइफेरी सीआरएफ 121 दूरभाष: (505) 272-2464